Bazni par

Bazni par (bp) je jedinica koja se sastoji od dvije nukleobaze povezane međusobno vodikovim vezama. Oni čine građevne blokove dvostruke spirale DNK i doprinose presavijenoj strukturi i DNK i RNK. Diktirani specifičnim uzorcima vezanja vodika, Watson-Crickovi osnovni parovi (guanin-citozin i adenin-timin) omogućuju DNK spirali održavanje pravilne spiralne strukture koja suptilno ovisi o nukleotidnoj sekvenci.^[1] Komplementarna priroda ove strukture temeljene na parovima osigurava suvišnu kopiju genetskih informacija kodiranih u svakom lancu DNK. Redovita struktura i redundiranost podataka koje pruža DNK dvostruka spirala čine DNK pogodnim za pohranu genetskih informacija, dok spajanje baza između DNK i ulaznih nukleotida omogućava mehanizam putem kojeg DNK polimeraza replicira DNK, a RNK polimeraza prepisuje DNK u RNK. Mnogi proteini koji se vežu na DNK mogu prepoznati specifične obrasce uparivanja baza koji identificiraju određene regulatorne regije gena.

Primjeri[uredi | uredi kôd]

Sljedeće DNK sekvence ilustriraju dvostruke nizove. Prema dogovoru, gornji pramen se piše od kraja 5 'do kraja 3'; na taj način se na donjem lancu piše 3 'do 5'.

Slijed DNK u bazi:

        *ATCGATTGAGCTCTAGCG
        *TAGCTAACTCGAGATCGC

Odgovarajuća RNK sekvenca, u kojoj je uracil supstituiran timinom u lancu RNK:

        *AUCGAUUGAGCUCUAGCG
        *UAGCUAACUCGAGAUCGC

Prefiksi[uredi | uredi kôd]

    *bp = osnovni par (i) - jedan bp odgovara približno 3,4 A (340 pm)^[2] duljine duž niti, i otprilike 618 ili 643 daltona za DNK i RNK.
    *kb (= kbp) = kilo baznih parova = 1.000 bp
    *Mb (= Mbp) = mega bazni parovi = 1,000,000 bp
    *Gb = parovi osnovnih giga = 1.000.000.000 bp.

Izvori[uredi | uredi kôd]

↑ Zhurkin VB, Tolstorukov MY, Xu F, Colasanti AV, Olson WK. 2005. Sequence-Dependent Variability of B-DNA. DNA Conformation and Transcription. str. 18–34. doi:10.1007/0-387-29148-2_2. ISBN 978-0-387-25579-8
↑ Alberts B, Johnson A, Lewis J, Morgan D, Raff M, Roberts K, Walter P. Prosinac 2014. Molecular Biology of the Cell 6th izdanje. Garland Science, Taylor & Francis Group. New York/Abingdon. str. 177. ISBN 978-0-8153-4432-2

Literatura[uredi | uredi kôd]

Watson JD, Baker TA, Bell SP, Gann A, Levine M, Losick R. 2004. Molecular Biology of the Gene 5th izdanje. Pearson Benjamin Cummings: CSHL Press (See esp. ch. 6 and 9)
Sigel A, Sigel H, Sigel RK, ur. 2012. Interplay between Metal Ions and Nucleic Acids. Metal Ions in Life Sciences. 10. Springer. doi:10.1007/978-94-007-2172-2. ISBN 978-9-4007-2171-5
Clever GH, Shionoya M. 2012. Chapter 10. Alternative DNA Base-Pairing through Metal Coordination. Interplay between Metal Ions and Nucleic Acids. Metal Ions in Life Sciences. 10. str. 269–294. doi:10.1007/978-94-007-2172-2_10. ISBN 978-94-007-2171-5. PMID 22210343
Megger DA, Megger N, Mueller J. 2012. Chapter 11. Metal-Mediated Base Pairs in Nucleic Acids with Purine and Pyrimidine-Derived Neucleosides. Interplay between Metal Ions and Nucleic Acids. Metal Ions in Life Sciences. 10. str. 295–317. doi:10.1007/978-94-007-2172-2_11. ISBN 978-94-007-2171-5. PMID 22210344

[1] Zhurkin VB, Tolstorukov MY, Xu F, Colasanti AV, Olson WK. 2005. Sequence-Dependent Variability of B-DNA. DNA Conformation and Transcription. str. 18–34. doi:10.1007/0-387-29148-2_2. ISBN 978-0-387-25579-8

[2] Alberts B, Johnson A, Lewis J, Morgan D, Raff M, Roberts K, Walter P. Prosinac 2014. Molecular Biology of the Cell 6th izdanje. Garland Science, Taylor & Francis Group. New York/Abingdon. str. 177. ISBN 978-0-8153-4432-2

[1]

[2]