Kvalifikacije za Hrvatsku republičku nogometnu ligu 1949. godinu su igrane po završetku natjecanja u zonama Prvenstva Hrvatske za 1948./49. u kojima su sudjelovali najbolji klubovi iz zonskih prvenstava. Zbog prebacivanja netjecateeljske sezone na kalenarsku godinu, Hrvatska liga je igrana za 1950. godinu. Zbog uvođenja Treće savezne lige, a širenja Hrvatske lige s 10 na 12 klubova, većina klubova iz kvalifikacija se plasirala u Hrvatsku ligu 1950.