Njegov otac bio je drugorođeni sin Ferdinanda I. tako da je Ferdinand mogao doći na vlast tek po izumrijeću potomaka prvorođenog sina Ferdinanda I. Maksimilijana II.. Smrću Matije 20. ožujka 1619. godine, koji ga je odredio za nasljednika, Ferdinand je okrunjen za cara. Njegova žestoka katolička politika dovodi do izbijanja Tridesetogodišnjeg rata koji je pri njegovom dolasku na vlast bio u začetku.
Godine 1630. je, unatoč odluci Hrvatskog sabora izdao Vlaški zakon (Statuta valachorum) u kojem Vlasi naseljeni u Križevačkoj, Koprivničkoj i Ivanićkoj kapetaniji zadržavaju svoje povlastice, koje su imali u Osmanskom Carstvu.
Niti njegova smrt 15. veljače 1637. godine nije uspjela zaustaviti Tridesetogodišnji rat.
Naslijedio ga je sin Ferdinand III..
krunski princ Oton·nadvojvoda Robert*** ·nadvojvoda Feliks·nadvojvoda Karlo Ludovik·nadvojvoda Rudolf· nadvojvoda Ferdinand Karlo · nadvojvoda Henrik Marija ·nadvojvoda Leopold Franjo** · nadvojvoda Guntram** · nadvojvoda Radbot** · nadvojvoda Ivan** · nadvojvoda Juraj** ·nadvojvoda Stjepan** · nadvojvoda Dominik** · nadvojvoda Fridrik Salvator** · nadvojvoda Andrija Salvator** · nadvojvoda Marko** · nadvojvoda Ivan** · nadvojvoda Mihovil** · nadvojvoda Franjo Salvator** · nadvojvoda Karlo Salvator** · nadvojvoda Josip Karlo · nadvojvoda Andrija Augustin · nadvojvoda Nikola Franjo · nadvojvoda Ivan Jakob · nadvojvoda Edvard Karlo · nadvojvoda Pavao Rudolf
18. generacija
nadvojvoda Karlo·nadvojvoda Juraj·nadvojvoda Lovro*** · nadvojvoda Gerhard*** · nadvojvoda Martin*** · nadvojvoda Karlo Filip · nadvojvoda Rajmund Josip · nadvojvoda Stjepan · nadvojvoda Rudolf ·nadvojvoda Karlo Kristijan· nadvojvoda Karlo Petar ·nadvojvoda Simeon· nadvojvoda Ivan · nadvojvoda Maksimilijan Henrik · nadvojvoda Filip Joakim · nadvojvoda Ferdinand Karlo · nadvojvoda Konrad ·nadvojvoda Žigmund** · nadvojvoda Juraj** · nadvojvoda Guntram** · nadvojvoda Leopold** · nadvojvoda Aleksandar Salvator** · nadvojvoda Tadej Salvator** · nadvojvoda Kazimir Salvator** · nadvojvoda Matija** · nadvojvoda Ivan** · nadvojvoda Bernhard** · nadvojvoda Benedikt · nadvojvoda Josip Albert · nadvojvoda Pavao Lav · nadvojvoda Fridrik Ciprijan · nadvojvoda Benedikt Aleksandar · nadvojvoda Nikola · nadvojvoda Santiago · nadvojvoda Pavao Benedikt
19. generacija
nadvojvoda Ferdinand Zvonimir· nadvojvoda Karlo Konstantin ·nadvojvoda Amadeo*** ·nadvojvoda Joakim*** · nadvojvoda Bartolomej*** · nadvojvoda Emanuel*** · nadvojvoda Lujo*** · nadvojvoda Feliks Karlo · nadvojvoda Andrija Franjo · nadvojvoda Pavao Ivan · nadvojvoda Karlo Kristijan · nadvojvoda Ivan · nadvojvoda Toma · nadvojvoda Franjo Ludovik · nadvojvoda Mihovil · nadvojvoda Josip · nadvojvoda Emerik · nadvojvoda Emerik · nadvojvoda Kristof · nadvojvoda Aleksandar · nadvojvoda Lovro Karlo · nadvojvoda Vilim · nadvojvoda Ivan · nadvojvoda Ludovik · nadvojvoda Filip · nadvojvoda Nikola · nadvojvoda Konstantin · nadvojvoda Jakob Maksimilijan · nadvojvoda Leopold Amadeo** · nadvojvoda Maksimilijan** · nadvojvoda Leopold** · nadvojvoda Konstantin Salvator** · nadvojvoda Pavao Salvator**
*također infant Španjolske **također princ Toskane ***također princ Modene